Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 YNR005CYNR005C 405 nt7.38□□□□□ -1.23
MSD1P15179 DSE3YOR264W 1293 nt7.38□□□□□ -1.23
MSD1P15179 MOD5YOR274W 1287 nt7.38□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YAH1YPL252C 519 nt7.38□□□□□ -1.23
MSD1P15179 CDC13YDL220C 2775 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 TAF4YMR005W 1167 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 MRPL24YMR193W 777 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 TAF9YMR236W 474 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YBL112CYBL112C 318 nt7.37□□□□□ -1.23
MSD1P15179 SAL1YNL083W 1485 nt7.36□□□□□ -1.23
MSD1P15179 MIX17YMR002W 471 nt7.36□□□□□ -1.23
MSD1P15179 ARO10YDR380W 1908 nt7.36□□□□□ -1.23
MSD1P15179 CRH1YGR189C 1524 nt7.36□□□□□ -1.23
MSD1P15179 ENB1YOL158C 1821 nt7.36□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YHP1YDR451C 1062 nt7.35□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YGL260WYGL260W 231 nt7.35□□□□□ -1.23
MSD1P15179 ASF1YJL115W 840 nt7.35□□□□□ -1.23
MSD1P15179 FCP1YMR277W 2199 nt7.35□□□□□ -1.23
MSD1P15179 PCL10YGL134W 1302 nt7.34□□□□□ -1.23
MSD1P15179 BRN1YBL097W 2265 nt7.34□□□□□ -1.23
MSD1P15179 YKL147CYKL147C 618 nt7.33□□□□□ -1.24
MSD1P15179 ERG24YNL280C 1317 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 APM4YOL062C 1476 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 STF1YDL130W-A 261 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YDR327WYDR327W 327 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 RRP46YGR095C 672 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YMR252CYMR252C 405 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 LIP5YOR196C 1245 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 RFS1YBR052C 633 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 SVF1YDR346C 1446 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 GDA1YEL042W 1557 nt7.32□□□□□ -1.24
MSD1P15179 FCY2YER056C 1602 nt7.31□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YEL074WYEL074W 339 nt7.31□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YIP4YGL198W 708 nt7.31□□□□□ -1.24
MSD1P15179 FMO1YHR176W 1299 nt7.31□□□□□ -1.24
MSD1P15179 LSC1YOR142W 990 nt7.31□□□□□ -1.24
MSD1P15179 GFA1YKL104C 2154 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 GCG1YER163C 699 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 TFG2YGR005C 1203 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 LYS12YIL094C 1116 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YOL079WYOL079W 399 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 AFG3YER017C 2286 nt7.3□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.29□□□□□ -1.24
MSD1P15179 LOT6YLR011W 576 nt7.29□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YLR463CYLR463C 552 nt7.29□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YOL099CYOL099C 492 nt7.29□□□□□ -1.24
MSD1P15179 DIT1YDR403W 1611 nt7.29□□□□□ -1.24
MSD1P15179 EXG2YDR261C 1689 nt7.28□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YNL234WYNL234W 1281 nt7.28□□□□□ -1.24
MSD1P15179 YBR138CYBR138C 1575 nt7.28□□□□□ -1.24
MSD1P15179 HAL5YJL165C 2568 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 RRP9YPR137W 1722 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 EAF5YEL018W 840 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 RSA3YLR221C 663 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 CTR1YPR124W 1221 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 OSW2YLR054C 2175 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 NUP49YGL172W 1419 nt7.27□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.26□□□□□ -1.25
MSD1P15179 NTG2YOL043C 1143 nt7.26□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YOR012WYOR012W 414 nt7.26□□□□□ -1.25
MSD1P15179 FSF1YOR271C 984 nt7.26□□□□□ -1.25
MSD1P15179 SNF4YGL115W 969 nt7.25□□□□□ -1.25
MSD1P15179 RNH201YNL072W 924 nt7.25□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YNL092WYNL092W 1203 nt7.25□□□□□ -1.25
MSD1P15179 DMC1YER179W 1005 nt7.24□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.24□□□□□ -1.25
MSD1P15179 MED6YHR058C 888 nt7.24□□□□□ -1.25
MSD1P15179 GPD2YOL059W 1323 nt7.24□□□□□ -1.25
MSD1P15179 POX1YGL205W 2247 nt7.23□□□□□ -1.25
MSD1P15179 snR78snR78 87 nt7.23□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YLL056CYLL056C 897 nt7.23□□□□□ -1.25
MSD1P15179 RPL43AYPR043W 279 nt7.23□□□□□ -1.25
MSD1P15179 RAI1YGL246C 1164 nt7.22□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YMR122CYMR122C 375 nt7.22□□□□□ -1.25
MSD1P15179 PRP40YKL012W 1752 nt7.22□□□□□ -1.25
MSD1P15179 CDC1YDR182W 1476 nt7.22□□□□□ -1.25
MSD1P15179 PPS1YBR276C 2424 nt7.21□□□□□ -1.25
MSD1P15179 YCR041WYCR041W 333 nt7.21□□□□□ -1.26
MSD1P15179 OM45YIL136W 1182 nt7.21□□□□□ -1.26
MSD1P15179 YBR113WYBR113W 483 nt7.21□□□□□ -1.26
MSD1P15179 IRC7YFR055W 1023 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 TDH2YJR009C 999 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 YJR115WYJR115W 510 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 AIM2YAL049C 741 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 YML018CYML018C 1182 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 YNL194CYNL194C 906 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 URE2YNL229C 1065 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 HST2YPL015C 1074 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 SRF1YDL133W 1314 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 GPI18YBR004C 1302 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 CLB4YLR210W 1383 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 ERG8YMR220W 1356 nt7.2□□□□□ -1.26
MSD1P15179 RDR1YOR380W 1641 nt7.19□□□□□ -1.26
MSD1P15179 DRS1YLL008W 2259 nt7.19□□□□□ -1.26
MSD1P15179 HIS1YER055C 894 nt7.19□□□□□ -1.26
MSD1P15179 YLR112WYLR112W 420 nt7.19□□□□□ -1.26
MSD1P15179 CMK2YOL016C 1344 nt7.19□□□□□ -1.26
MSD1P15179 NUP84YDL116W 2181 nt7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.3 ms