Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spta1P08032 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spta1P08032 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spta1P08032 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spta1P08032 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spta1P08032 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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