Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn3P06796 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn3P06796 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn3P06796 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms