Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01647 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01647 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01647 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01647 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01647 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01647 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01647 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01647 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01647 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01647 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01647 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01647 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01647 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01647 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01647 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01647 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01647 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P01647 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01647 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01647 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01647 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01647 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01647 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P01647 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01647 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01647 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01647 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01647 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01647 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01647 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01647 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01647 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01647 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01647 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01647 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01647 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01647 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01647 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01647 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01647 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01647 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01647 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01647 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01647 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P01647 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01647 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01647 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01647 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01647 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01647 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P01647 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01647 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01647 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01647 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01647 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01647 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01647 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01647 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01647 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01647 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01647 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01647 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01647 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms