Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc6a20bO88575 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc6a20bO88575 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc6a20bO88575 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc6a20bO88575 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc6a20bO88575 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms