Protein–RNA interactions for Protein: O70374

Cbfa2t2, Protein CBFA2T2, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbfa2t2O70374 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbfa2t2O70374 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbfa2t2O70374 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cbfa2t2O70374 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbfa2t2O70374 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms