Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BckdkO55028 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BckdkO55028 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BckdkO55028 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BckdkO55028 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BckdkO55028 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BckdkO55028 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BckdkO55028 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BckdkO55028 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BckdkO55028 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms