Protein–RNA interactions for Protein: O35486

Crygs, Beta-crystallin S, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygsO35486 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CrygsO35486 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CrygsO35486 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CrygsO35486 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CrygsO35486 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CrygsO35486 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CrygsO35486 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms