Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp616J3QN14 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp616J3QN14 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp616J3QN14 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms