Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lcG5E8I7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp17lcG5E8I7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17lcG5E8I7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26■■□□□ 1.75
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