Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colca2F8VPY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Colca2F8VPY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms