Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox13F6YCR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms