Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-99F6XWB2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms