Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pagr1bF6V0H0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pagr1bF6V0H0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1bF6V0H0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms