Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp31E9Q6Y8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp31E9Q6Y8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp31E9Q6Y8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms