Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl3E0CZ16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl3E0CZ16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms