Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1110002E22RikE0CYV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1110002E22RikE0CYV9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms