Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrr3B2RXA8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabrr3B2RXA8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms