Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed5B2RPU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed5B2RPU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed5B2RPU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms