Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M5A7VMS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-M5A7VMS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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