Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor2A7M7C7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor2A7M7C7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor2A7M7C7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor2A7M7C7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms