Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13941A2AJ38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm13941A2AJ38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13941A2AJ38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13941A2AJ38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.6 ms