Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a3A2ACT7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a3A2ACT7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a3A2ACT7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms