Protein–RNA interactions for Protein: A2ACJ2

Faap100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap100A2ACJ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faap100A2ACJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faap100A2ACJ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faap100A2ACJ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faap100A2ACJ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms