Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc173A0JLY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc173A0JLY1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms