Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms