Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms