Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms