Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms