Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid3bQ9Z1N7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid3bQ9Z1N7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arid3bQ9Z1N7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid3bQ9Z1N7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid3bQ9Z1N7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms