Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lbx2Q9WUN8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lbx2Q9WUN8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx2Q9WUN8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms