Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6cQ9WTM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema6cQ9WTM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6cQ9WTM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6cQ9WTM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms