Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmb3Q9R1P1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb3Q9R1P1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms