Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Zeb2Q9R0G7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Zeb2Q9R0G7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zeb2Q9R0G7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zeb2Q9R0G7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zeb2Q9R0G7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms