Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnckQ9QYK9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PnckQ9QYK9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnckQ9QYK9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms