Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxe3Q9QY14 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxe3Q9QY14 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxe3Q9QY14 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxe3Q9QY14 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms