Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PolkQ9QUG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolkQ9QUG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PolkQ9QUG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolkQ9QUG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms