Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfmbt1Q9JMD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms