Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a3Q9JLI2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col5a3Q9JLI2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms