Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng3Q9JJV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng3Q9JJV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng3Q9JJV5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng3Q9JJV5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng3Q9JJV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng3Q9JJV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng3Q9JJV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng3Q9JJV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms