Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJD0

Thap11, THAP domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap11Q9JJD0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thap11Q9JJD0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thap11Q9JJD0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thap11Q9JJD0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thap11Q9JJD0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thap11Q9JJD0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms