Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud2Q9JJC9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herpud2Q9JJC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms