Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek6Q9ES70 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nek6Q9ES70 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek6Q9ES70 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms