Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SgshQ9EQ08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SgshQ9EQ08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SgshQ9EQ08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SgshQ9EQ08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms