Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erv3Q9DAX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Erv3Q9DAX3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Erv3Q9DAX3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Erv3Q9DAX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Erv3Q9DAX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms