Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D8Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms