Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf225Q9D7D1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf225Q9D7D1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf225Q9D7D1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms