Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms