Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus10Q9D3U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pus10Q9D3U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pus10Q9D3U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms