Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnal2Q9D3R6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnal2Q9D3R6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnal2Q9D3R6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms